Vrozené nemoci pochvy a vyšších oddílů vnitřního genitálu představují různě rozsáhlá zdvojení daná nesplynulými Mülleriánskými základy těchto struktur.

 

Získané nemoci pochvy – zánětlivá i nádorová onemocnění mohou být doprovázena výtokem nebo krvácením. I zde se uplatňuje onkogenní účinek papilomavirů – vznikají prekancerózy VAIN (vaginální intraepitelové neoplazie) a z nich  se může vyvinout karcinom.