Informační systémy ve zdravotnictví

5.6.2 PubMed a PubMed Central

PubMed je webové rozhraní, které volně zpřístupňuje databázi Národní lékařské knihovny USA Medline. PubMed Central je repozitář, který archivuje veřejně přístupné plné texty vědeckých článků.
Jednoduché vyhledávání všech záznamů v Medline
Přístup k vyhledávacímu formuláři je na adrese http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/. V rozbalovacím seznamu  vybereme zdroj údajů – PubMed, do textového pole zadáme klíčová slova (např. cholesterol diet children) a potvrdíme tlačítkem Search.
 
Zobrazí se stránka se seznamem nalezených dokumentů a výběrem názvu daného dokumentu dojde k zobrazení jeho abstraktu. V seznamu může být u dokumentů zobrazena poznámka Free Article nebo Free PMC Article. Dokumenty s poznámkou Free PMC Article jsou volně dostupné v elektronické verzi v repozitáři PubMed Central a je k nim jednoduchý přístup přímo přes rozhraní PubMed. Dokumenty s poznámkou Free Article bývají volně dostupné na jiných webových stránkách a PubMed nabízí odkaz na tento zdroj. U ostatních dokumentů může PubMed nabízet odkaz na zdroj s daným materiálem, který však nebývá volně dostupný a přístup k němu je určitým způsobem omezen.
 
Pokročilé vyhledávání všech záznamů v Medline
Volbou Advanced zobrazenou pod výběrovým textovým polem se zobrazí stránka s formulářem umožňujícím zadat specifické podmínky výběru.
 
Do textového pole ƒ lze ručně zapsat podmínku pro vyhledávání záznamů. Toto pole je třeba nejprve zpřístupnit odkazem Edit zobrazeným pod tímto polem. Jednodušší je však zadávat podmínky pomocí polí umístěných níže. Rozbalovací seznam specifikuje údaj, v kterém se bude vyhledávat klíčové slovo zapsané do textového pole . Generovaný dotaz se automaticky zobrazuje v textovém poli ƒ.
 
Zobrazení abstraktu a plného textu vyhledaného článku
Při použití jednoduchého i pokročilého vyhledávání odpovídajících záznamů se zobrazí stránka s jejich seznamem a základními údaji.
 
Při kliknutí na název daného dokumentu se přepneme na stránku s abstraktem, popřípadě s odkazem na plný text.
U dokumentů s poznámkou Free PMC Article, se pod zobrazeným abstraktem objevuje náhled dokumentu. Plný text vyvoláme výběrem odkazu Free text nebo Free PMC Article. Jako formát textu lze volit standardní webové zobrazení, pohled PubReader jež je alternativní webová prezentace, která nabízí srozumitelnější způsob, jak číst literaturu v PMC repozitáři nebo standardní PDF.
 
U dokumentů s poznámkou Free Article se pod abstraktem zobrazuje odkaz LinkOut - more resource, po jehož výběru se rozbalí seznam s možnými odkazy na plný text. Alespoň některý z odkazů by měl vést k volnému plnému textu.
 
U některých ostatních dokumentů se pod abstraktem může objevit volba pro zobrazení plného textu, v tomto případě se však jedná o odkazy, které vedou k zpoplatněným či jinak omezeným stránkám.
 
Vyhledání dokumentů s plným textem v repozitáři PubMed Center
Pokud potřebujeme vyhledat pouze dokumenty, u kterých je jednoduchý přístup k plným textům přes PubMed Center, můžeme použít jednoduché vyhledávání záznamů a v rozbalovacím seznamu  vybereme PMC.
 
V zobrazeném seznamu budou pouze dokumenty s přístupem k plnému textu, kdy pod každým záznamem je výběr, v jakém formátu lze daný dokument zpřístupnit.